El equipo de baloncesto de la Escuela Secundaria Teikou se corona campeón tres años seguidos gracias a cinco jugadores sobresalientes que, con sus impresionantes y únicas habilidades, dejan a sus oponentes en la desesperación y a los aficionados en la admiración. Sin embargo, después de graduarse, estos compañeros de equipo, conocidos como "La Generación de los Milagros", van por caminos separados y ahora se consideran unos a otros como rivales. En Seirin High School, dos estudiantes de primer año recién reclutados demuestran que no son jugadores de baloncesto comunes: Taiga Kagami, una prometedora jugadora que regresa de Estados Unidos, y Tetsuya Kuroko, una estudiante aparentemente corriente cuya falta de presencia le permite moverse sin ser notado. Aunque Kuroko no es atlético ni capaz de anotar ningún punto, fue miembro del equipo de baloncesto de Teikou, donde jugó como el "Sexto Fantasma", que fácilmente pasó la pelota y asistió a sus compañeros de equipo. Kuroko no Basket sigue el viaje de los jugadores de Seirin en su intento de convertirse en el mejor equipo de secundaria japonés al ganar el Campeonato Interhigh. Para alcanzar su objetivo, tienen que cruzar caminos con varios equipos poderosos, algunos de los cuales tienen uno de los cinco jugadores con habilidades divinas, a los que Kuroko y Taiga hacen un pacto para derrotar.